1　　わざわざメールを送っていただき、ありがとうございますから入り、定年を迎えられておめでとうございます。
の様に、お祝いの言葉を述べる。
1.5　個人あてに来たメールの場合

　　退職に対しての感想を告げる

素晴らしいです！でも寂しいです・・・等
2　　お相手様には、いろいろして頂いて、ありがとうございました。
の様に、
今までのお世話になった内容を記して感謝を述べる。
3　　第２の人生でも活躍してください

の様に、応援の言葉を述べる。
3.5　個人あてに来たメールの場合

相手の体調を気遣う言葉を入れるといい感じっぽくなります。
4　　最後に、もう一度感謝を述べて締める。

この様な、内容となります。

具体的に、例を出しながら解説してみます。

1
御多用のところ、退職の挨拶をして頂き、誠にありがとうございます。

この度ご定年を迎えられたこと、心よりお祝い申し上げます。

上記の様に、
とりあえず忙しい中、わざわざ御報告ありがとうございます的な、感謝を述べます。

そして、おめでとうございます等の お祝いの言葉に続けます。

1.5
緒江良井部長が定年退職をされることは存じておりましたが、いざこの日を迎えると、やはり寂しい気持ちでいっぱいです。

個人的に送っていただいた場合、
やはり寂しさを募らせる気持ちを伝える事がいいと思います。

うにゃこ

一斉メールみたいに、半分業務連絡の様なメールを頂いた時は、
この様な文は書かなくてもいいかと思います。

うにゃこ

一斉メールと言う事は、それほど面識のない御方でしょうから、
寂しい言われても、そんな心にもない事を・・・と
逆に受け取られる可能性がありますからね。

2
緒江良井部長には、野良捕獲企画にて、大変お世話になりました。

ご教授いただいた、○○に関しての考え方は、今では自分の指標とさせていただいております。

この様に、個人宛てで挨拶を貰った場合は、
何かしらの 具体的なエピソードがあると思いますので、
そのことを強調してお礼を述べるのがいいかと思います。

そして続けて
時には厳しく、時には優しくご指導いただいたおかげで、今日まで勤めて来ることが出来ました。

公私関わらず、悩みを抱えていた時も支えていただき、本当にありがとうございました。

メールが送られてくる限り、少なかれ対応してもらった事があるはずですので、この様に、一言お礼を述べる形で続けます。

3
緒江良井部長の今後の新しい環境でも、ご健勝とご活躍を心よりお祈りいたします。

と、今後の未来も明るくあって下さいの様に、
ポジティブな言葉を贈ります。

ここで　注意

そのお相手が、この後どうするかを知っているのでしたらいいのですが、
知らない場合 NGになりやすい言葉もあります。

例：のんびりお過ごしください系
もしかしたら、別の職についてまだまだ働くかもしれません。

例：奥様と一緒に○○系
奥様との仲を知っているならいざ知らず・・・
な下手すると地雷案件・・・
<(ﾟﾛﾟ;)>ﾉｫｵｵｵｵｵ!!

例：人生まだまだこれからです　、まだまだお若いのですから系
逆に、年寄り扱いされている（怒）と、取られる可能性があるそうです・・・
!?(ﾟ〇ﾟ;)ｲﾜﾚﾃﾐﾚﾊﾞ･･･